群體遺傳分析平臺推薦1、全基因組重測序分析平臺
全基因組重測序是對已知基因組序列的物種進行不同個體的二代或三代基因組測序,并在此基礎上對個體或者群體進行變異檢測分析。利用百邁客全基因組重測序分析云平臺,只需要上傳原始data,打開主流程APP,即可完成從原始數據到結題報告的轉化。不僅可以下載結果,而且可以在云平臺上面做云個性化分析,不僅可以在線查看位點SNP、InDel、SV、CNV等信息,還可以支持設計引物、進化樹分析等功能。

二代重測序云平臺

三代重測序云平臺
群體遺傳分析平臺推薦2、BSA分析平臺
BSA(Bulked segregant analysis)作為一種快速的性狀定位分析方法,可以極大地降低研究的工作量和成本,該方法主要是選擇雙親群體分離后代中具有極端表型的個體進行混樣,通過比較不同極端混樣池之間的多態性標記的差異,從而篩選出與性狀相關的分子標記,實現目標基因的定位。百邁客BSA分析云平臺現已正式實現云交付,可以提供BSA分析云服務,實現原始數據一步上傳,分析參數自主設置,除此之外,BSA分析云平臺還提供常見個性化分析等服務。將助力BSA成為更快速、更低價、性價比更高的性狀定位分析!

群體遺傳分析平臺推薦3、全基因組關聯分析平臺
全基因組關聯分析(Genome wide association study,GWAS)是對多個個體在全基因組范圍的遺傳變異(標記)多態性進行檢測,獲得基因型,進而將基因型與可觀測的性狀,即表型,進行群體水平的統計學分析,根據統計量或顯著性p 值篩選出最有可能影響該性狀的遺傳變異(標記),挖掘與性狀變異相關的基因。全基因組關聯分析云平臺只需要提供常規的基因型文件(VCF文件)和需要分析的表型數據,即可得到多個模型的定位結果。APP中自嵌合了親緣關系分析,群體結構(固定效應)、場次、性別、批次等因素可以通過協方差文件傳入。即可拿到分析的曼哈頓圖和QQ圖,以及對應的注釋區間。

群體遺傳分析平臺推薦4、遺傳進化分析平臺
群體遺傳進化是研究群體的遺傳結構及其變化規律。其應用數學和統計學方法研究群體中基因頻率和基因型頻率以及影響這些頻率的選擇效應和突變作用,研究遷移和遺傳漂變等與遺傳結構的關系。該分析平臺目前只需要提供基因型文件(VCF格式)和分組信息。即可完成遺傳進化分析。系統進化樹、PCA、遺傳多樣性分析、群體結構、親緣關系、LD、選擇性清除等即可一鍵獲得結果文件。
群體遺傳分析平臺推薦5、遺傳圖譜分析平臺
遺傳圖譜(Genetic map),是基于全基因組重測序技術或簡化基因組測序技術,對某物種家系樣本進行測序,利用生物信息學方法,開發SNP分子標記,計算標記間的遺傳連鎖距離,繪制高密度遺傳圖譜。利用遺傳圖譜,可以用來進行性狀QTL定位。該分析平臺,可以可輕松實現遺傳圖譜的構建。
目前百邁客群體遺傳相關項目已經實現了云交付。百邁客云分析平臺整合了目前最主流的分析流程,結果準確有保證,分析過程簡單易上手,從數據上傳到參數設置,再到基因組選擇,只需簡單幾步就可以完成項目數據的投遞和分析;結題報告云交付,分析完成即可拿到項目結果。
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百邁客自成立以來,深耕群體遺傳研究領域,在群體遺傳進化及性狀定位方面積累了大量的項目經驗,研究物種數百種,定位性狀上萬個,發表文章數百篇,累計影響因子2300+;極大促進了我國群體遺傳研究的發展。
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