生物科研人員發文章必不可少的就是對測序數據梳理整合,目前比較火爆的分析內容有關鍵基因篩選,基因家族分析,排名前十的GO注釋分類圖,特定功能相關基因的互作網絡圖,多個分組共有差異基因通路展示,轉錄因子預測及功能分析等等。這些分析怎么做?需要提供什么數據?收費貴不貴?多久能拿到結果?我能不能自己做?
轉錄組數據分析目前比較模式化,要想贏得審稿人青睞,必須要結合具體的科學問題做針對性展示。轉錄組數據分析挖掘幾步走?我們將眾多的分析內容歸納為4大類:所有基因挖掘、差異基因挖掘、表達量挖掘、高級工具挖掘。
1、所有基因挖掘
針對所有檢測到的基因,我們可以用基因名稱、功能注釋、序列信息等進行檢索篩選;基于篩選的關鍵基因或者前期研究結果,重點關注某類基因家族,從序列信息比對、功能結構域保守性分析、家族進化樹分析、表達模式分析等進行研究,進而解析基因家族與生物學性狀的關系。
2、差異基因挖掘
差異基因挖掘是基于差異基因篩選,實現不同分組間差異表達基因的比較、功能注釋和通路富集分析等,解析參與生物學過程的關鍵基因及其功能。
3、表達量挖掘
表達量挖掘可以根據各個基因的表達量,實現不同樣品中共同表達和特異表達的基因的篩選,如組織特有表達基因篩選、不同處理樣品間特異表達基因篩選、不同發育時期特異表達基因篩選等,并對特定基因進行后續功能分類分析,如聚類分析,表達模式分析等。
4、高級工具挖掘
高級工具挖掘主要是整合基因表達量與表型數據、互作信息、其他組學信息,進行基因共表達網絡(WGCNA)、蛋白互作網絡圖、組學聯合分析等,解析基礎代謝過程和轉錄調控網絡。

針對上面這些分析內容,百邁客生物云平臺免費開放了不限次的個性化挖掘和108款作圖小工具,一鍵出圖。百邁客云于2014年5月正式開放,經過6年的打磨,轉錄組云分析(次賬號)集結可視化數據分析APP、個性化分析小工具、文獻檢索、公共數據庫、培訓視頻,是科研工作者項目管理一站式平臺。在這個風起“云”涌的時代,百邁客云以快速、全面、透明的姿態全面起航。

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